東京大学大学院理学系研究科の附属施設で、日本最古の植物園です。1684（貞享元）年、麻布の地にあった幕府の薬園が、5代将軍徳川綱吉の別邸に移され開園した「小石川御薬園」が始まりで、1877（明治10）年に東京大学の附属施設となり一般公開されました。約16万㎡もの敷地に、展示用の建物や温室、日本庭園などがあり、地形にあわせて植えられた梅林やツツジ園、ツバキ園など多様な景観が楽しめます。物理学者ニュートンの生家のリンゴの木が接ぎ木された「ニュートンのリンゴ」、遺伝学の祖・メンデルの実験に使われたブドウの分株「メンデルのブドウ」など、世界有数の記念樹も見ることができます。